More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2479 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 345 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  58.23 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  45.43 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  45.43 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  45.43 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 		 332 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 		 332 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  40.19 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  36.28 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  35.98 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  35.98 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  25.77 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  25.09 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  31.37 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.37 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  36.67 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.4 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.53 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  26.71 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.54 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  29.34 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  35.33 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  31.58 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  30.62 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  39.55 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  31.55 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  25.9 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  28.09 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  32.47 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.45 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.37 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  29.01 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  30.5 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.74 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  37.96 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  34.09 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.25 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  31.55 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  32.94 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  35.43 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  25.33 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  31.55 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  31.55 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>