More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3836 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 328 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  58.23 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  41.43 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  41.43 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  41.43 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  41.12 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  41.12 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  41.12 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  37.65 
 
 		 323 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  33.23 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  32.92 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  32.92 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  28.48 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.79 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  38.69 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  33.93 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.67 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  34.52 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  25.59 
 
 		 294 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.41 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  31.55 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  31.55 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  39.58 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.73 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  34.78 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  28.65 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  27.1 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  24.55 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  29.41 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  27.1 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  32.24 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  27.1 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.56 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.94 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  26.36 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  35.51 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  25.8 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>