More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0469 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  99.7 
 
 
332 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  99.7 
 
 
332 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  99.4 
 
 
332 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  99.4 
 
 
332 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  99.4 
 
 
332 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
332 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  49.38 
 
 
323 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 
345 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  41.43 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  35.6 
 
 
341 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  35.29 
 
 
341 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  35.29 
 
 
341 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.04 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.74 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  28.18 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  27.23 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.77 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  33.54 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 
292 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  25.73 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.52 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.2 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  29.38 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  25.99 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.04 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  24.31 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  29.57 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30.57 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  33.12 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  26.79 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.4 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.3 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  29.56 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  23.92 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  27.31 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  30.57 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.14 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>