More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4205 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 323 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  49.69 
 
 		 332 aa  331  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  49.69 
 
 		 332 aa  331  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  49.38 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  49.07 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  49.07 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  49.07 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  40.19 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  37.65 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  33.75 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.47 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.11 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.96 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.9 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.22 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.11 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.34 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  28.49 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.78 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.5 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  26.34 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.21 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  28.4 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.18 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  26.73 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.63 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  26.29 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  25.89 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  25.28 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  27.63 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  26.46 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.73 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  27.73 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  25.87 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  26.19 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  25.91 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.68 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>