More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1605 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  99.38 
 
 
341 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
322 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
322 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  99.38 
 
 
341 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
322 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  99.07 
 
 
341 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  35.83 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  35.83 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  35.83 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
332 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
332 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  35.5 
 
 
332 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  36.77 
 
 
345 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 
323 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  34.33 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  31.06 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  29.87 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  32.18 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 
291 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.52 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 
310 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 
291 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 
309 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  30.55 
 
 
304 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 
298 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
313 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
290 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  31.33 
 
 
306 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 
297 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 
301 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 
304 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  29.87 
 
 
304 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  28.74 
 
 
304 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 
292 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.19 
 
 
290 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 
301 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 
290 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  34.73 
 
 
295 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
290 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  31.2 
 
 
302 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 
290 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  38.82 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  33.02 
 
 
290 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
291 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  31.29 
 
 
305 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 
292 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  27.82 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  32.88 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
304 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 
314 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.7 
 
 
297 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 
294 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.53 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  27.56 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  25.19 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  34.78 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  29.49 
 
 
302 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 
332 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  27.99 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  28.7 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 
294 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.84 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
291 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 
290 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 
297 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
292 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 
297 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  36.81 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>