More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1099 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1101  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  248  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244372  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 240 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  28.75 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  31.74 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  30.74 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  31.28 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.44 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.88 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.71 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.36 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  31.78 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.84 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  31.22 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  28.14 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  32.34 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1255  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.03 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  29.18 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  31.49 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  32.44 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  31.78 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.33 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  31.78 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  29.87 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.61 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.51 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.49 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  30.96 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.74 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.38 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2538  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.49 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0479  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1763  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.127578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>