More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2394 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  36.02 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  35.81 
 
 		 218 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.19 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  34.27 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1682  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000361446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1216  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000203871  normal  0.637592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 233 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1676  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000350308  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2070  transcriptional regulatory protein YedW  34.18 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15395e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01884  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  34.18 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000533293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01874  hypothetical protein  34.18 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000061937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.44 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.04 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.04 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.04 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.04 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.04 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  33.75 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  33.06 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  33.06 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  33.06 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  32.37 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  33.47 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  34.75 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  35.27 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  35.04 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  35.04 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  34.75 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  34.31 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  30.47 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  34.89 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  34.89 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  33.74 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  33.75 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0479  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  34.05 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  34.48 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  32.13 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  30.04 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.76 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  32.49 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  32.78 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  30.04 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2517  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0413154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>