More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3388 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 255 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 219 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  33.66 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  29.96 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  38.15 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  38.15 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  31.92 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  28.27 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1927  two component transcriptional regulator  27.95 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0440711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  29.83 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  28.03 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  27.43 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  28.03 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  27 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  31.44 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.13 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0777  two-component response regulator  28.87 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000399592  decreased coverage  0.000157294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4496  two-component response regulator  31.17 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  29.36 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3825  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.862228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  27.97 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  27.43 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  27.9 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2517  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.14 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  30.57 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  30.7 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  30.7 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  27.85 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  28.27 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  29.87 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2538  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  29.44 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  28.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  29.71 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  29.71 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>