More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2671 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2538  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0479  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  34.06 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  35.24 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.32 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  34.57 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  30.47 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  36.77 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.9 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  30.64 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  30.04 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  30.64 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000288449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  30.04 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  30.04 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  30.04 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  29.61 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  29.61 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  30.21 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  29.61 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  29.61 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  29.61 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  29.61 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  29.61 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  29.18 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0777  two-component response regulator  29.18 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000399592  decreased coverage  0.000157294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  32.5 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0082  two-component response regulator  30.3 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  30.17 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  29.18 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  31.6 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  32.22 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  35.68 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  29.18 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.34 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.34 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  29.79 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3241  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.57 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.34 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  29.79 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  28.51 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  31.86 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.12 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.94 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  28.09 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  32.75 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  32.34 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  29.79 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  33.63 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  28.09 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.48 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  32.6 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  28.94 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>