More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2538 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2538  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  32.02 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0354  putative two-component response regulator  30.63 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2570  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000747651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.26 
 
 		 265 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  31.44 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.44 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0238  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.31 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4710  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5586  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.9 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2140  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.05 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1559  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.204072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  31.53 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.63 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3034  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.3 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32.3 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.18 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0229  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.38 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  30.04 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.19 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.53 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  30.49 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.53 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  26.61 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.53 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.53 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2804  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000183823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  28 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.53 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30.36 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  28.9 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>