More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1728 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3615  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.32 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  39.65 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  39.57 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  39.57 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  39.57 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  39.57 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  39.57 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  39.57 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  39.57 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  39.82 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.85 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  39.13 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  39.13 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.66 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.66 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.22 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.74 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  40.17 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.97 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  36.6 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.17 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.74 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  39.91 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  38.26 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  40.35 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.35 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.41 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.96 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  39.91 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>