More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1025 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.89 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  31.38 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.45 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.36 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  34.22 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  32.02 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3034  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  31.14 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.13 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.3 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.05 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.64 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 227 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  31.67 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  30.77 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  34.36 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  29.49 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  32.07 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  34.18 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  32.37 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  30.9 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  30.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  32.47 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  31.25 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  32.34 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  29.39 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  27.71 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  31.12 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  28.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.19 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>