More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1540 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  33.48 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1763  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.127578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  31.56 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.64 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  32.51 
 
 		 248 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  32.24 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.8 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  32.39 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.95 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3034  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6059  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.39 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.64 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  34.41 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  34.41 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  32.16 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  32.07 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  34.44 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.88 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.88 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.88 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3294  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.77 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0118223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  31.98 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.84 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  29.88 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0650  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000493918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.75 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.06 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.86 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.96 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.34 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.51 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  30.54 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.92 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  31.36 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  28.98 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.32 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  30.25 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.67 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3692  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0674602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.58 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3749  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.545663  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  27.46 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  27.46 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0576  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00494054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>