More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0943 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 241 aa  175  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 219 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  33.48 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 224 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  32.9 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  33.04 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 225 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  33.77 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.19 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.19 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  32.19 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.19 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  32.19 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  31.35 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  32.03 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  31.6 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.65 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  31.76 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  31.76 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.17 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  30.42 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.57 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1255  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  32.24 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  30.74 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  32.03 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  30.9 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  33.33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>