More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1255 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1255  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  30.67 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  31.14 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  33.48 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  33.48 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  28.57 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  30.14 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3580  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0214492  hitchhiker  0.00000165063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  32.44 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.16 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.6 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  30.17 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.13 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.91 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.38 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 395 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  28.32 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  31.67 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2538  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  30.3 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  30.3 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  30.6 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  30.3 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  29.74 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3825  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.862228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  29.36 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  29.74 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  31.25 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  36.31 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  31.25 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  31.25 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  31.25 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  29.15 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  29.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>