More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3375 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.19 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 256 aa  357  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  73.25 
 
 		 256 aa  351  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.78 
 
 		 261 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  68.89 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 		 235 aa  284  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 228 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.44 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 240 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 233 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 234 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.15 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  38.36 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.82 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 250 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.19 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  36.71 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  47.34 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  38.67 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  38.67 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  35.53 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  39.3 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.29 
 
 		 209 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.29 
 
 		 209 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.29 
 
 		 209 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.91 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.16 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  34.57 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.43 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  36.32 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.16 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 233 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  36 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>