More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0376 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  32.75 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.89 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.47 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.2 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  33.47 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.03 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.74 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.81 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  30.3 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  30.08 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.19 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.19 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.19 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.74 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  30.18 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  32.31 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  30.6 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  31.7 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  29.87 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  31.38 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  29.87 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.36 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.02 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  32.02 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  31.38 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  29.44 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.57 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3034  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.29 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.43 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>