More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0108 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.26 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  27.47 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.85 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.63 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.39 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  25.21 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  27.9 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.14 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  26.27 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  26.67 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.97 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1101  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244372  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.87 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  25.31 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4214  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.29 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4035  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.29 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4052  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.29 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4107  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.29 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4156  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.29 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00998  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with TorS  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2647  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1111  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1106  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2130  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01005  hypothetical protein  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2600  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2320  DNA-binding transcriptional regulator TorR  26.16 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.369642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  26.58 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  22.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  25.96 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  23.71 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1230  DNA-binding transcriptional regulator TorR  25.74 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.97 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  25.63 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  22.51 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  25.96 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  26.05 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.94 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  31.47 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  22.51 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  22.51 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000288449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  25.42 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.16 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0681  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000276194  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  26.09 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  25.63 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  23.28 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  22.41 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  22.84 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  25.11 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  27.9 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  24.79 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  26.38 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  25.11 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  29.05 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  21.55 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  22.69 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  23.02 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  23.01 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.61 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0082  two-component response regulator  23.95 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  25.32 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  23.53 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  27.71 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>