More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1101 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  248  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1101  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  246  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244372  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 240 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 260 aa  90.5  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  38 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0108  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 243 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000433811  normal  0.0161608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.88 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0479  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  28.87 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  25.71 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  27.84 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 223 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 232 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 232 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 226 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 253 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  24.14 
 
 		 245 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  29.57 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 227 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  32.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0166  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.77 
 
 		 239 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.96 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  35.06 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.84 
 
 		 244 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  33.03 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.53 
 
 		 240 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2943  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.723084  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  33.03 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.79 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  35.14 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  25.89 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2437  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  27.12 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  35.8 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 246 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 225 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>