More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1563 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1255  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  36.84 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  33.48 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  36.84 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.81 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  35.93 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  35.02 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.5 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  34.96 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.33 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.36 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  33.77 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  33.33 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  33.19 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  37.17 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.69 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.47 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  37.17 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  35.56 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 246 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 260 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  30.94 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  35.14 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  35.11 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  30.49 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  34.23 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3232  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  30.34 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  31.91 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.91 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>