More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0200 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  59.57 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  59.13 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  58.72 
 
 		 242 aa  279  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  58.33 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  57.5 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.52 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  46.81 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.61 
 
 		 237 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.86 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.06 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  43.04 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.22 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.67 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.12 
 
 		 236 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.12 
 
 		 236 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  42.55 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  42.55 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.12 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.03 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.03 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.03 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.44 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.03 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.04 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3534  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.49 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.06 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3241  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  42.17 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  42.17 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  42.17 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  41.28 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  43.28 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  42.17 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  42.61 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  42.61 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  39 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  42.17 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  42.61 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  38.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  38.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  38.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  38.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  38.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  41.28 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  38.14 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  39.83 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  42.17 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  38.08 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>