More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5669 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  100 
 
 		 348 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5083  Band 7 protein  90.55 
 
 		 345 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5534  SPFH domain / Band 7 family protein  89.39 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2814  hypothetical protein  82.84 
 
 		 339 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33080  hypothetical protein  84.35 
 
 		 337 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000208318  hitchhiker  0.00231515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  71.23 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  30.31 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  29.09 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  28.52 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  30.04 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  28.57 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  29.02 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  28.29 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  28.86 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  27.84 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  27.76 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  26.98 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  27.57 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  25.58 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  27.17 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  27.37 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  26.6 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  26.49 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  26.58 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  26.83 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  28.31 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  26.99 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  26.83 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  26.97 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  26.42 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  24.56 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  23.53 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  27.41 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.82 
 
 		 284 aa  89.7  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  26.92 
 
 		 313 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  26.59 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  26.05 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  24.13 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  26.37 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  28.15 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  23.53 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  26.62 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  28.67 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  28.67 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  25.52 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  27.31 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  26.74 
 
 		 326 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  26.52 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  30.2 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  27.87 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  24.56 
 
 		 289 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  24.83 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  25.9 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  24.91 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  25 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  23.99 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  25.09 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  28.28 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  22.77 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  26.62 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  26.62 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  25.5 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  27.18 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  27.18 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  23.65 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  25.69 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  27.07 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  27.59 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  25.27 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  26.84 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  25.44 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  25.86 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  23.53 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  27.12 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  23.45 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  22.77 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  22.77 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  26.47 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  25.25 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  27.34 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  24.74 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  24.09 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  24.44 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  23.63 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  25.45 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  25.25 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  28.09 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  22.08 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  26.56 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  23.37 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  26.01 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  22.29 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  24.12 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  22.04 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  24.5 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  24.24 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  28.08 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>