130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2045 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.03 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 308 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2887  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.43 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  24.22 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  24.39 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.66 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  34.12 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  36.59 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  35.21 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  21.37 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  23.2 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 156 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 		 176 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 168 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  24.56 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  28.04 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>