More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1109 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  61.11 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  58.28 
 
 		 301 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  59 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  58.33 
 
 		 307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  42.86 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  44.33 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  43.58 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 307 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.52 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.92 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  42.67 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.45 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.62 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.99 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  39.87 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  49.09 
 
 		 512 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.25 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.42 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.87 
 
 		 594 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  36.72 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  38.76 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  38.49 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  41.04 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47.96 
 
 		 590 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  48.2 
 
 		 510 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  40.8 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  45.23 
 
 		 590 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  37.21 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  37.99 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  38.54 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.89 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  38.72 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  37.74 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  36.54 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  36.36 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  38.38 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  38.21 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  37.46 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  39.35 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  37.34 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  39.1 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 583 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  37.86 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  42.6 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.94 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  43.44 
 
 		 578 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.44 
 
 		 575 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.78 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  35.56 
 
 		 651 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  36.04 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  43.44 
 
 		 583 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  44.29 
 
 		 617 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  43.14 
 
 		 578 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.27 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  35.69 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  44.34 
 
 		 247 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  37.64 
 
 		 578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 585 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.91 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 578 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.91 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.38 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  44.44 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 589 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 579 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  43.64 
 
 		 270 aa  196  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 		 576 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  41.26 
 
 		 580 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  37.58 
 
 		 593 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  41.89 
 
 		 579 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  43.95 
 
 		 576 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.93 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>