More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2550 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  100 
 
 
330 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  48.12 
 
 
339 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
328 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1510  ABC transporter related  47.95 
 
 
360 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  44.97 
 
 
312 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  38.56 
 
 
325 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  37.03 
 
 
322 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  38.59 
 
 
307 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
307 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  33.12 
 
 
324 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
241 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
248 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.59 
 
 
315 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
241 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  41.07 
 
 
241 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  35.69 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
248 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
242 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  37.38 
 
 
346 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  37.38 
 
 
346 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.83 
 
 
308 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.05 
 
 
346 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
241 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
241 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.48 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  37.18 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  42.73 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  44.86 
 
 
512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
583 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.19 
 
 
314 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  33.97 
 
 
335 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  38.53 
 
 
582 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  42.17 
 
 
307 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  34.38 
 
 
314 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
589 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  36.64 
 
 
580 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  36.64 
 
 
580 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
320 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.15 
 
 
323 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.66 
 
 
308 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  36.33 
 
 
319 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 
576 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 
327 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  36.01 
 
 
318 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  36.01 
 
 
318 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  36.01 
 
 
318 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  38.64 
 
 
247 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  39.64 
 
 
590 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  36.01 
 
 
318 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  43.12 
 
 
283 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
585 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  39.06 
 
 
599 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  39.72 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  35.02 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  34.7 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
308 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
411 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  33.12 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  39.37 
 
 
590 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  42.01 
 
 
299 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  37.75 
 
 
594 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40 
 
 
593 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
222 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 
322 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.1 
 
 
326 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
580 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  34.82 
 
 
310 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
222 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  37.55 
 
 
579 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.21 
 
 
580 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  37.93 
 
 
576 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  33.01 
 
 
313 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
578 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
578 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  40.6 
 
 
1171 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  36.16 
 
 
318 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  37.83 
 
 
583 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  40.09 
 
 
617 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  35.28 
 
 
305 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  37.66 
 
 
580 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
578 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
578 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  33.95 
 
 
318 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  37.99 
 
 
585 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  33.23 
 
 
319 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
578 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  33.94 
 
 
323 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.29 
 
 
575 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  34.8 
 
 
323 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  37.67 
 
 
270 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  40.51 
 
 
322 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  36.99 
 
 
248 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  36.1 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  40.36 
 
 
915 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>