More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3742 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  100 
 
 		 339 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1510  ABC transporter related  89.33 
 
 		 360 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  48.12 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  46.67 
 
 		 312 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  35.54 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 589 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  32.92 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  35.31 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  41.99 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40.93 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  39.19 
 
 		 248 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  41.96 
 
 		 593 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  41.99 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.87 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 248 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  32.53 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.43 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 583 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  34.18 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  37.06 
 
 		 314 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  34.18 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  34.18 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  38.31 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  34.37 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  35.18 
 
 		 317 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  40.62 
 
 		 255 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  33.86 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  35.46 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  44.65 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  38.74 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.29 
 
 		 593 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 242 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  38.2 
 
 		 576 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  36.08 
 
 		 580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 241 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 241 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  34.88 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.48 
 
 		 512 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  42.67 
 
 		 588 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  40.09 
 
 		 590 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.39 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  44.09 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  39.04 
 
 		 583 aa  179  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  39.38 
 
 		 590 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  41.46 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  35.69 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 		 576 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  33.76 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  32.9 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  34.29 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  36.67 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  31.96 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.66 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  38.12 
 
 		 582 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.83 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  40.09 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.51 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  39.46 
 
 		 510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  38.64 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 248 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.99 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  39.21 
 
 		 580 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  36.91 
 
 		 581 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 		 309 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  31.87 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.49 
 
 		 580 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 580 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.02 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  34.43 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  37.34 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  35.2 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 		 222 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  36.44 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>