More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1510 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1510  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  89.33 
 
 		 339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  47.32 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  44.94 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.15 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 589 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  41.13 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  35.97 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  41.07 
 
 		 593 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40.69 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  31.97 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  41.13 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 248 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  38.26 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 583 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  33.44 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  33.44 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  33.44 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  38.74 
 
 		 248 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  34.58 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  38.52 
 
 		 593 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  34.19 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  33.12 
 
 		 318 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  34.41 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  33.69 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  34.22 
 
 		 319 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  38.12 
 
 		 241 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.13 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  35.43 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  32.59 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  40.72 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  33.55 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  39.17 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  38.02 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  32.6 
 
 		 320 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  33.65 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  35.65 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  37.67 
 
 		 582 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.57 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  34.52 
 
 		 580 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  35.84 
 
 		 580 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  33.44 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 580 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  45.13 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  41.35 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 241 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  34.52 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.96 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  35.28 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  36.73 
 
 		 576 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.01 
 
 		 583 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.67 
 
 		 512 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  42.04 
 
 		 286 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  37.73 
 
 		 585 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  39.22 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  35.24 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  39.63 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 576 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.05 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  36.67 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  32.05 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  38.64 
 
 		 580 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  38.29 
 
 		 594 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.29 
 
 		 590 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39.82 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.57 
 
 		 510 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  36.07 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 248 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.07 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>