More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5638 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  64 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  63.04 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  58.28 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  55.81 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  42.72 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.72 
 
 		 314 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  42.62 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  42.33 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  41.31 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  48.46 
 
 		 512 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.97 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.46 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  40.53 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.52 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  39.87 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  41.95 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  39.94 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  39.8 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.07 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 319 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.1 
 
 		 510 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.5 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  43.8 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  43.41 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  43.19 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.2 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  38.87 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  38.41 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44.14 
 
 		 575 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 1171 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  40.77 
 
 		 587 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  38.11 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  38.08 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  38.11 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 583 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  38.75 
 
 		 578 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.29 
 
 		 594 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.92 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  42.47 
 
 		 578 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  38.69 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  38.21 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  36.84 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  45.54 
 
 		 580 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  36.6 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  39.93 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  43.38 
 
 		 593 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 350 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.02 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  36.69 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  44.64 
 
 		 585 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  39.86 
 
 		 580 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  44.55 
 
 		 581 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.13 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 580 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  38.52 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  37.5 
 
 		 590 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  38.74 
 
 		 582 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  35.57 
 
 		 354 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 576 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 579 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  42.4 
 
 		 590 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  36.72 
 
 		 580 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  36.72 
 
 		 580 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.93 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  34.45 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 589 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 343 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  43.18 
 
 		 576 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  37.87 
 
 		 599 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.49 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  43.05 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  39.91 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 578 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>