More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20188 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  100 
 
 		 693 aa  1427    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  30.87 
 
 		 1001 aa  228  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  29.98 
 
 		 828 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  29.19 
 
 		 842 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  29.03 
 
 		 844 aa  208  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  28.74 
 
 		 826 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  28.47 
 
 		 731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  37.85 
 
 		 1115 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  28.44 
 
 		 731 aa  183  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  27.41 
 
 		 727 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  38.18 
 
 		 1035 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  27.05 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  28.65 
 
 		 736 aa  178  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  28.55 
 
 		 730 aa  177  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  27.05 
 
 		 727 aa  177  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  26.44 
 
 		 727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  27.36 
 
 		 727 aa  174  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  26.99 
 
 		 740 aa  173  9e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  29.09 
 
 		 730 aa  173  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  26.95 
 
 		 736 aa  173  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  29.43 
 
 		 732 aa  172  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  27.54 
 
 		 740 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  27.91 
 
 		 740 aa  167  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  26.48 
 
 		 740 aa  164  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  27.73 
 
 		 740 aa  163  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  28.39 
 
 		 734 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  28.83 
 
 		 730 aa  158  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  26.01 
 
 		 974 aa  158  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  27.54 
 
 		 730 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  37.56 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  37.1 
 
 		 729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  37.1 
 
 		 728 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  36.65 
 
 		 728 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  36.65 
 
 		 729 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  36.44 
 
 		 730 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  24.36 
 
 		 978 aa  137  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  43.87 
 
 		 734 aa  137  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  24.56 
 
 		 994 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  33.33 
 
 		 848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  23.93 
 
 		 985 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  39.51 
 
 		 730 aa  124  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  47.24 
 
 		 607 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 607 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  47.24 
 
 		 607 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  46.97 
 
 		 611 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  48.03 
 
 		 602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  48.03 
 
 		 602 aa  119  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 609 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  47.24 
 
 		 603 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 609 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  37.13 
 
 		 623 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  46.46 
 
 		 604 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 607 aa  117  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  33.1 
 
 		 609 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 609 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  47.24 
 
 		 603 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 603 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 605 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  46.46 
 
 		 609 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  46.15 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  46.88 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  45.67 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  45.67 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2939  putative elongation factor Tu, GTP binding domain  45.67 
 
 		 609 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  45.67 
 
 		 609 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  38.46 
 
 		 608 aa  114  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  24.08 
 
 		 1013 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  44.19 
 
 		 608 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  44.19 
 
 		 608 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 607 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  45.74 
 
 		 605 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  44.88 
 
 		 609 aa  114  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  46.62 
 
 		 615 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  43.85 
 
 		 608 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  45.67 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  46.09 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  44.88 
 
 		 603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  44.88 
 
 		 608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  43.85 
 
 		 606 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  45.67 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>