More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0152 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  46.26 
 
 		 736 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  53.06 
 
 		 734 aa  772    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  59.78 
 
 		 730 aa  856    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  58.31 
 
 		 732 aa  842    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  58.22 
 
 		 730 aa  850    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  86.97 
 
 		 729 aa  1293    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  52.88 
 
 		 727 aa  766    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  45.58 
 
 		 736 aa  667    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  59.37 
 
 		 731 aa  884    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  100 
 
 		 729 aa  1477    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  53.01 
 
 		 727 aa  767    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  59.15 
 
 		 731 aa  884    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  88.48 
 
 		 728 aa  1309    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  58.63 
 
 		 730 aa  872    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  87.38 
 
 		 729 aa  1303    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  87.11 
 
 		 728 aa  1310    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  51.99 
 
 		 727 aa  769    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  53.57 
 
 		 727 aa  769    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  52.74 
 
 		 727 aa  763    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  57.26 
 
 		 730 aa  820    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  60.19 
 
 		 730 aa  858    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  45.12 
 
 		 734 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  43.37 
 
 		 740 aa  620  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  41.39 
 
 		 730 aa  593  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  40.46 
 
 		 740 aa  590  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  40.74 
 
 		 740 aa  588  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  40.6 
 
 		 740 aa  587  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  39.92 
 
 		 740 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.57 
 
 		 844 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  32.51 
 
 		 848 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  32.02 
 
 		 842 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  32.32 
 
 		 826 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  31.37 
 
 		 688 aa  286  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  30.48 
 
 		 706 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  30.05 
 
 		 689 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.58 
 
 		 705 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  28.55 
 
 		 704 aa  263  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.88 
 
 		 691 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  29.36 
 
 		 692 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.06 
 
 		 696 aa  261  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  29.68 
 
 		 700 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.01 
 
 		 700 aa  260  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  28.94 
 
 		 691 aa  260  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.28 
 
 		 691 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  28.71 
 
 		 701 aa  260  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  28.92 
 
 		 701 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  28.67 
 
 		 704 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  28.65 
 
 		 704 aa  259  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  29.28 
 
 		 704 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  29.25 
 
 		 695 aa  258  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  29.32 
 
 		 694 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  29.32 
 
 		 694 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  28.04 
 
 		 704 aa  258  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  28.77 
 
 		 700 aa  257  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.01 
 
 		 801 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  29.01 
 
 		 704 aa  257  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.01 
 
 		 802 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  28.57 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  29.14 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  28.57 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  29.01 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  28.57 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  28.93 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  29.53 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  28.93 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  29.36 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  28.93 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  28.93 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  28.49 
 
 		 703 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  29.35 
 
 		 698 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  28.4 
 
 		 702 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  28.96 
 
 		 700 aa  254  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  28.89 
 
 		 698 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  28.89 
 
 		 698 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  28.73 
 
 		 703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  29.97 
 
 		 701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  29.15 
 
 		 704 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  30.13 
 
 		 689 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  28.55 
 
 		 700 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.42 
 
 		 704 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  29.88 
 
 		 700 aa  253  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029839  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  28.61 
 
 		 699 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  30.45 
 
 		 692 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  29.74 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  28.36 
 
 		 747 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  28.49 
 
 		 701 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  28.51 
 
 		 701 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  28.73 
 
 		 703 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  28.73 
 
 		 703 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000147912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  29.68 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  28.57 
 
 		 700 aa  252  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  29.58 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>