More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2828 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  47.41 
 
 
736 aa  683    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  44.19 
 
 
740 aa  655    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  59.35 
 
 
734 aa  884    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  44.46 
 
 
740 aa  648    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  68.67 
 
 
730 aa  1006    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  78.66 
 
 
730 aa  1183    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  43.52 
 
 
740 aa  641    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  44.73 
 
 
740 aa  650    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  57.55 
 
 
727 aa  826    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  57.89 
 
 
727 aa  834    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  81.4 
 
 
731 aa  1243    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  100 
 
 
731 aa  1505    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  57.73 
 
 
727 aa  836    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  59.15 
 
 
729 aa  884    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  69.08 
 
 
730 aa  1041    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  46.73 
 
 
736 aa  674    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  58.02 
 
 
727 aa  842    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  57.73 
 
 
727 aa  831    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  60.19 
 
 
728 aa  895    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  60.33 
 
 
728 aa  884    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  78.39 
 
 
730 aa  1173    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  60.11 
 
 
729 aa  869    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  68.08 
 
 
730 aa  995    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  60.11 
 
 
729 aa  875    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  46.79 
 
 
734 aa  687    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  75.1 
 
 
732 aa  1122    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  43.78 
 
 
740 aa  645    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.35 
 
 
730 aa  620  1e-176  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  32.53 
 
 
828 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  33.38 
 
 
695 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  32.97 
 
 
697 aa  299  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  32.12 
 
 
692 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  32.97 
 
 
701 aa  297  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  31.01 
 
 
691 aa  296  8e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  32.19 
 
 
701 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.26 
 
 
706 aa  296  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  32.19 
 
 
692 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  31.94 
 
 
701 aa  296  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  30.8 
 
 
695 aa  295  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  31.54 
 
 
705 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  31.5 
 
 
692 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.68 
 
 
692 aa  294  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  31.23 
 
 
691 aa  294  5e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  32.23 
 
 
701 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  30.92 
 
 
691 aa  293  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.33 
 
 
700 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  31.05 
 
 
695 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  31.05 
 
 
695 aa  292  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  31.72 
 
 
692 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  30.79 
 
 
691 aa  291  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  30.79 
 
 
691 aa  291  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  30.39 
 
 
699 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  30.04 
 
 
703 aa  290  6e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  31 
 
 
692 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  31.95 
 
 
698 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.91 
 
 
693 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.13 
 
 
706 aa  289  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  30.55 
 
 
697 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.11 
 
 
689 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  31.45 
 
 
691 aa  288  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  30.77 
 
 
691 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  32.12 
 
 
691 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  31.85 
 
 
694 aa  287  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  31.53 
 
 
700 aa  286  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  29.74 
 
 
692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  31.43 
 
 
691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  29.37 
 
 
702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  31.11 
 
 
691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  31.43 
 
 
691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.17 
 
 
696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  31.07 
 
 
691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  31.11 
 
 
691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.7 
 
 
715 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  30.84 
 
 
691 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  30.73 
 
 
697 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  30.38 
 
 
698 aa  283  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  30.62 
 
 
691 aa  283  9e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  30.65 
 
 
696 aa  283  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  30.75 
 
 
701 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.5 
 
 
691 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  31.31 
 
 
692 aa  282  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.9 
 
 
692 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  30.69 
 
 
698 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  31.14 
 
 
698 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  30.51 
 
 
699 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  30.9 
 
 
692 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.9 
 
 
692 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  32.03 
 
 
700 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  30.9 
 
 
692 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  32.03 
 
 
700 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  31.14 
 
 
698 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  31.14 
 
 
698 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  31.25 
 
 
691 aa  281  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  30.38 
 
 
705 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  30.26 
 
 
695 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  31.14 
 
 
698 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  30.69 
 
 
692 aa  281  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.9 
 
 
692 aa  281  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  32.57 
 
 
691 aa  280  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.11 
 
 
692 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>