More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1304 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  52.74 
 
 		 729 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  92.3 
 
 		 727 aa  1410    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  47.4 
 
 		 736 aa  681    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  53.22 
 
 		 728 aa  767    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  44.55 
 
 		 740 aa  637    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  58.79 
 
 		 734 aa  878    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  96.42 
 
 		 727 aa  1453    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 740 aa  641    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  56.73 
 
 		 731 aa  828    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  98.76 
 
 		 727 aa  1479    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.18 
 
 		 730 aa  637    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  53.09 
 
 		 728 aa  749    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  57.77 
 
 		 730 aa  834    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  46.3 
 
 		 736 aa  667    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  57.28 
 
 		 730 aa  816    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  57.73 
 
 		 731 aa  836    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  58.65 
 
 		 730 aa  838    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  57.3 
 
 		 730 aa  842    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  44.98 
 
 		 740 aa  652    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  45.47 
 
 		 740 aa  651    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  56.39 
 
 		 732 aa  784    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  52.95 
 
 		 729 aa  761    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  54.73 
 
 		 729 aa  770    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  81.57 
 
 		 727 aa  1260    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  58.73 
 
 		 730 aa  841    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 740 aa  639    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  48 
 
 		 734 aa  693    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  100 
 
 		 727 aa  1494    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  30.32 
 
 		 842 aa  358  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.82 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.2 
 
 		 696 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  30.73 
 
 		 715 aa  312  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  31.33 
 
 		 697 aa  306  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  30.46 
 
 		 688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  30.25 
 
 		 704 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  30.12 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  30.12 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  30.65 
 
 		 709 aa  303  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  30.12 
 
 		 704 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  32.61 
 
 		 697 aa  302  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  30.12 
 
 		 802 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  30.15 
 
 		 703 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  30.34 
 
 		 703 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30.77 
 
 		 692 aa  302  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  30.4 
 
 		 698 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  30.12 
 
 		 801 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  31.28 
 
 		 692 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.59 
 
 		 692 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  31.12 
 
 		 700 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  30.89 
 
 		 700 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  30.24 
 
 		 701 aa  300  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  32.11 
 
 		 691 aa  300  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  31.72 
 
 		 695 aa  300  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  29.71 
 
 		 708 aa  300  9e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  31.47 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  30.76 
 
 		 700 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  30.01 
 
 		 747 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.42 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  31.13 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  31.13 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  29.99 
 
 		 704 aa  299  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  31.08 
 
 		 698 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  32.03 
 
 		 698 aa  298  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  30.99 
 
 		 700 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  31.41 
 
 		 698 aa  297  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  31.08 
 
 		 703 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  31.84 
 
 		 691 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  31.84 
 
 		 691 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  31 
 
 		 698 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  30.98 
 
 		 700 aa  296  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  30.85 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  30.81 
 
 		 697 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  30.39 
 
 		 696 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.69 
 
 		 706 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  31.23 
 
 		 698 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  30.85 
 
 		 700 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  30.17 
 
 		 699 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  30.08 
 
 		 703 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  32.02 
 
 		 688 aa  295  3e-78  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  30.85 
 
 		 700 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  29.88 
 
 		 701 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.81 
 
 		 702 aa  294  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  31.22 
 
 		 698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  31.22 
 
 		 698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  31.22 
 
 		 698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  31.22 
 
 		 698 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  30.32 
 
 		 699 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  31.08 
 
 		 700 aa  293  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  30.98 
 
 		 697 aa  293  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.85 
 
 		 691 aa  293  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  30.43 
 
 		 700 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  30.99 
 
 		 692 aa  292  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  30.8 
 
 		 689 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>