More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0084 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  84.78 
 
 		 736 aa  1326    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  47.48 
 
 		 730 aa  665    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  46.32 
 
 		 728 aa  655    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  45.58 
 
 		 729 aa  650    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  48.3 
 
 		 730 aa  733    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  55.33 
 
 		 740 aa  861    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  54.64 
 
 		 740 aa  874    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  54.23 
 
 		 740 aa  855    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  46.44 
 
 		 727 aa  669    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  49.18 
 
 		 730 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  45.58 
 
 		 729 aa  667    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  46.3 
 
 		 727 aa  667    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  49.93 
 
 		 734 aa  702    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  46.99 
 
 		 727 aa  676    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  46.73 
 
 		 731 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  47.82 
 
 		 730 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  54.1 
 
 		 740 aa  851    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  46.79 
 
 		 727 aa  677    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  57.08 
 
 		 740 aa  894    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  45.71 
 
 		 729 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  45.78 
 
 		 728 aa  665    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  47.52 
 
 		 727 aa  676    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  48.29 
 
 		 730 aa  684    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  47.61 
 
 		 730 aa  667    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  100 
 
 		 736 aa  1495    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  48.02 
 
 		 731 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  59.38 
 
 		 734 aa  936    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  46.61 
 
 		 732 aa  633  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  35.06 
 
 		 828 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  32.19 
 
 		 848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.49 
 
 		 826 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.85 
 
 		 844 aa  312  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  33.91 
 
 		 842 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  31.16 
 
 		 698 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  30.15 
 
 		 697 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  29.84 
 
 		 691 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  29.77 
 
 		 701 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  28.85 
 
 		 704 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2773  elongation factor G  30.81 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000856998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  29.76 
 
 		 701 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  30.88 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  28.55 
 
 		 700 aa  284  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  30.36 
 
 		 698 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  30.36 
 
 		 698 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  30.23 
 
 		 698 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  30.15 
 
 		 698 aa  283  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  29.59 
 
 		 699 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  30.56 
 
 		 698 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  30.56 
 
 		 698 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  30.56 
 
 		 698 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  30.16 
 
 		 701 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  29.28 
 
 		 699 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  30.56 
 
 		 698 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  29.51 
 
 		 701 aa  283  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  30.41 
 
 		 698 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  28.59 
 
 		 704 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  30.35 
 
 		 695 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  29.85 
 
 		 693 aa  280  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  29.14 
 
 		 699 aa  280  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  29.51 
 
 		 698 aa  280  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  28.65 
 
 		 707 aa  280  9e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  29.87 
 
 		 698 aa  280  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  29.47 
 
 		 704 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  29.6 
 
 		 698 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  28.95 
 
 		 697 aa  280  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.1 
 
 		 703 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  29.37 
 
 		 704 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  29.51 
 
 		 704 aa  279  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.6 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  29.37 
 
 		 704 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.37 
 
 		 801 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  29.38 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  29.37 
 
 		 704 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  29.38 
 
 		 703 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000147912 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  28.51 
 
 		 688 aa  277  5e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.04 
 
 		 705 aa  277  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  30.38 
 
 		 700 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  29.84 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  28.34 
 
 		 708 aa  273  7e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.03 
 
 		 700 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  29.84 
 
 		 698 aa  273  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  29.77 
 
 		 708 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  0.00000914286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  28.65 
 
 		 691 aa  273  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  30.34 
 
 		 698 aa  273  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  29.64 
 
 		 701 aa  273  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  29.42 
 
 		 723 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  28.92 
 
 		 700 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  29.17 
 
 		 694 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  29.49 
 
 		 694 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  28.88 
 
 		 994 aa  273  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  29.03 
 
 		 692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.61 
 
 		 696 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  28.99 
 
 		 701 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  29.33 
 
 		 691 aa  271  4e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  29.85 
 
 		 692 aa  270  7e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28 
 
 		 704 aa  270  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  28.32 
 
 		 703 aa  270  7e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  28.17 
 
 		 705 aa  270  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  28.84 
 
 		 698 aa  270  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  29.14 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>