More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0504 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  91.36 
 
 
729 aa  1352    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  46.39 
 
 
736 aa  658    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  88.48 
 
 
728 aa  1303    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  59.78 
 
 
730 aa  853    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  58.9 
 
 
730 aa  858    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  87.65 
 
 
728 aa  1315    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  60.05 
 
 
731 aa  890    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  54.6 
 
 
727 aa  780    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  58.06 
 
 
732 aa  828    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  52.93 
 
 
734 aa  765    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  54.73 
 
 
727 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  60.11 
 
 
731 aa  882    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  86.97 
 
 
729 aa  1310    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  45.71 
 
 
736 aa  656    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  57.95 
 
 
730 aa  872    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  55.77 
 
 
727 aa  797    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  60.74 
 
 
730 aa  862    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  54.32 
 
 
727 aa  777    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  100 
 
 
729 aa  1476    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  54.05 
 
 
727 aa  780    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  59.32 
 
 
730 aa  842    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  44.26 
 
 
734 aa  625  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  43.37 
 
 
740 aa  607  9.999999999999999e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  41.7 
 
 
740 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  40.88 
 
 
740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  41.15 
 
 
740 aa  579  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  41.65 
 
 
730 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  40.74 
 
 
740 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  31.87 
 
 
688 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  29.67 
 
 
693 aa  278  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.28 
 
 
706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  29.76 
 
 
701 aa  274  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.78 
 
 
696 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  30.38 
 
 
695 aa  270  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.69 
 
 
705 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  32.43 
 
 
844 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  30.74 
 
 
698 aa  269  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  30.2 
 
 
694 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  30.2 
 
 
694 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  29.69 
 
 
700 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  29.2 
 
 
691 aa  267  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.71 
 
 
696 aa  267  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  29.85 
 
 
689 aa  268  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  28.7 
 
 
700 aa  267  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  29.58 
 
 
699 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  30.05 
 
 
697 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  29.72 
 
 
702 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  29.82 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  29.82 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  29.64 
 
 
698 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  29.74 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.65 
 
 
691 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  30.79 
 
 
701 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  29.74 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  29.74 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.03 
 
 
700 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  29.74 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  29.7 
 
 
691 aa  262  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  29.96 
 
 
704 aa  262  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.37 
 
 
691 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  28.67 
 
 
704 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0270  elongation factor G  29.59 
 
 
702 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000351784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  30.19 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  28.98 
 
 
699 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000527224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  29.88 
 
 
698 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.08 
 
 
697 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  29.78 
 
 
698 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  29.23 
 
 
700 aa  261  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  29.01 
 
 
703 aa  260  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  29.04 
 
 
698 aa  260  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  30 
 
 
698 aa  260  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  30.25 
 
 
701 aa  259  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.62 
 
 
801 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  29.63 
 
 
702 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.62 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  29.46 
 
 
695 aa  259  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  29.96 
 
 
698 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  28.89 
 
 
985 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  29.63 
 
 
704 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  29.01 
 
 
704 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  29.43 
 
 
703 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  31.03 
 
 
697 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  29.63 
 
 
704 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  29.59 
 
 
698 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  29.63 
 
 
704 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  29.55 
 
 
700 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  29.18 
 
 
706 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  29.63 
 
 
704 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  29.62 
 
 
700 aa  257  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  29.49 
 
 
704 aa  257  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  28.65 
 
 
702 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  29.49 
 
 
704 aa  257  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  28.65 
 
 
702 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>