More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0820 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  49.25 
 
 
736 aa  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  67.35 
 
 
730 aa  1004    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  47.61 
 
 
736 aa  693    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  65.57 
 
 
732 aa  959    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  69.82 
 
 
730 aa  1045    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  69.92 
 
 
730 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  68.86 
 
 
731 aa  1039    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  59.32 
 
 
729 aa  858    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  58.6 
 
 
727 aa  863    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  45.28 
 
 
740 aa  656    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  45.08 
 
 
740 aa  653    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  58.57 
 
 
728 aa  853    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  60.41 
 
 
734 aa  883    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  58.9 
 
 
727 aa  857    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  68.08 
 
 
731 aa  1026    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  58.9 
 
 
729 aa  855    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  70.33 
 
 
730 aa  1095    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  45.14 
 
 
740 aa  653    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  58.87 
 
 
727 aa  868    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  58.57 
 
 
728 aa  867    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  58.73 
 
 
727 aa  866    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  57.26 
 
 
729 aa  850    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  45.08 
 
 
740 aa  664    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  100 
 
 
730 aa  1494    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  58.32 
 
 
727 aa  862    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  48.08 
 
 
734 aa  714    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  45.28 
 
 
740 aa  657    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.14 
 
 
730 aa  624  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  36.71 
 
 
828 aa  315  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  36.33 
 
 
844 aa  311  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  37.02 
 
 
848 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.74 
 
 
842 aa  297  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  36.44 
 
 
826 aa  294  5e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.38 
 
 
706 aa  289  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  31.55 
 
 
703 aa  287  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  30.76 
 
 
695 aa  286  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  31.36 
 
 
701 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  29.44 
 
 
691 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  30.36 
 
 
689 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  30.84 
 
 
691 aa  280  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  30.68 
 
 
692 aa  280  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  30.52 
 
 
691 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  30.63 
 
 
695 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  30.52 
 
 
691 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  277  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  30.05 
 
 
700 aa  275  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  30.41 
 
 
692 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  30.87 
 
 
692 aa  273  6e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.11 
 
 
691 aa  273  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  30 
 
 
688 aa  273  6e-72  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  31.27 
 
 
704 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  30.84 
 
 
700 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  30.52 
 
 
697 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  30.46 
 
 
698 aa  271  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  31.08 
 
 
695 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  30.64 
 
 
700 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  30.36 
 
 
699 aa  267  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  30.36 
 
 
691 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30 
 
 
706 aa  266  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  30.36 
 
 
691 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  29.8 
 
 
700 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  29.5 
 
 
704 aa  265  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  29.8 
 
 
698 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  28.17 
 
 
693 aa  264  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  29.07 
 
 
689 aa  264  4.999999999999999e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  29.93 
 
 
698 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  29.8 
 
 
700 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  28.82 
 
 
699 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  29.8 
 
 
700 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  30.38 
 
 
700 aa  263  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0597  elongation factor G  28.18 
 
 
704 aa  263  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0295214  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  30.9 
 
 
708 aa  263  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  29.84 
 
 
698 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  30.41 
 
 
691 aa  263  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  29.66 
 
 
700 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  30.11 
 
 
692 aa  261  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  28.69 
 
 
698 aa  261  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  29.77 
 
 
683 aa  261  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  30.25 
 
 
700 aa  260  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  30.22 
 
 
690 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  29.52 
 
 
697 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  29.34 
 
 
705 aa  258  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  256  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000582121  unclonable  0.000000000247136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.84 
 
 
691 aa  256  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  30.31 
 
 
673 aa  256  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  29.13 
 
 
700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  30.25 
 
 
701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  29.84 
 
 
693 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  28.28 
 
 
701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5571  translation elongation factor G  29.08 
 
 
702 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  30.12 
 
 
701 aa  254  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  29.32 
 
 
702 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  29.19 
 
 
689 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.31 
 
 
704 aa  251  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  29.05 
 
 
730 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1835  elongation factor G  28.34 
 
 
699 aa  250  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>