More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1613 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  57.03 
 
 
727 aa  818    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  45.8 
 
 
736 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  100 
 
 
732 aa  1499    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  77.15 
 
 
731 aa  1154    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  67.31 
 
 
730 aa  971    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  56.32 
 
 
727 aa  798    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  58.31 
 
 
729 aa  866    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  56.39 
 
 
727 aa  804    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  56.33 
 
 
727 aa  803    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  46.61 
 
 
736 aa  653    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  75.1 
 
 
731 aa  1146    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  77.29 
 
 
730 aa  1129    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  58.45 
 
 
729 aa  849    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  67.58 
 
 
730 aa  1011    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  58.28 
 
 
728 aa  852    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  57.3 
 
 
734 aa  847    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  58.06 
 
 
729 aa  840    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  56.66 
 
 
727 aa  809    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  65.57 
 
 
730 aa  955    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  74.28 
 
 
730 aa  1093    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  45.9 
 
 
734 aa  657    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  58.39 
 
 
728 aa  868    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  43.79 
 
 
740 aa  627  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  43.19 
 
 
740 aa  610  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  42.43 
 
 
740 aa  610  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  44.78 
 
 
730 aa  608  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  42.51 
 
 
740 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  42.51 
 
 
740 aa  600  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  33.98 
 
 
828 aa  422  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  31.78 
 
 
842 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  30.34 
 
 
695 aa  297  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  30.34 
 
 
695 aa  296  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  30.74 
 
 
705 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  35.92 
 
 
848 aa  293  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  31.74 
 
 
700 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  31.74 
 
 
700 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  30.64 
 
 
695 aa  291  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  31.21 
 
 
691 aa  291  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  29.93 
 
 
697 aa  290  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  30.81 
 
 
697 aa  290  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  34.68 
 
 
844 aa  287  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.52 
 
 
700 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  31.67 
 
 
688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  30.5 
 
 
706 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  31.43 
 
 
700 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.32 
 
 
703 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  29.97 
 
 
692 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31 
 
 
696 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  30.45 
 
 
692 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.43 
 
 
702 aa  284  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  30.59 
 
 
692 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  31.02 
 
 
691 aa  282  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  30.09 
 
 
692 aa  282  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.31 
 
 
704 aa  282  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  30.77 
 
 
700 aa  281  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30.84 
 
 
692 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  30.03 
 
 
704 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  29.76 
 
 
704 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  30.91 
 
 
692 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  29.78 
 
 
692 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.6 
 
 
692 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  30.44 
 
 
699 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.32 
 
 
692 aa  278  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  277  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  29.87 
 
 
693 aa  277  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  29.82 
 
 
692 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  29.89 
 
 
704 aa  277  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.05 
 
 
692 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  30.18 
 
 
692 aa  277  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  30.83 
 
 
692 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  29.78 
 
 
692 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  29.92 
 
 
698 aa  276  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  29.92 
 
 
692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  29.78 
 
 
692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  30.33 
 
 
689 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  29.33 
 
 
701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  31.71 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  29.33 
 
 
701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  29.97 
 
 
691 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  29.33 
 
 
701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  30.69 
 
 
692 aa  275  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  30.63 
 
 
697 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  30.01 
 
 
698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  29.51 
 
 
705 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  30.77 
 
 
700 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  29.89 
 
 
697 aa  273  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.01 
 
 
696 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  30.2 
 
 
698 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  29.92 
 
 
696 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.05 
 
 
715 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  30.52 
 
 
698 aa  272  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  30.92 
 
 
696 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  30.5 
 
 
700 aa  272  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  30.97 
 
 
698 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  29.23 
 
 
703 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  30.3 
 
 
704 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  30.08 
 
 
691 aa  271  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>