More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0279 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  48.7 
 
 		 736 aa  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  45.07 
 
 		 740 aa  658    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  57.14 
 
 		 727 aa  843    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  57.42 
 
 		 727 aa  837    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  58.12 
 
 		 734 aa  880    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  48.29 
 
 		 736 aa  704    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  45.75 
 
 		 740 aa  662    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  69.59 
 
 		 730 aa  1028    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  59.78 
 
 		 729 aa  866    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  45.49 
 
 		 740 aa  661    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  45.48 
 
 		 740 aa  660    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  59.59 
 
 		 728 aa  885    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  57.28 
 
 		 727 aa  837    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  60.74 
 
 		 729 aa  874    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  60.27 
 
 		 728 aa  873    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  78.66 
 
 		 731 aa  1209    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  74.28 
 
 		 732 aa  1092    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  59.78 
 
 		 729 aa  881    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  70.68 
 
 		 730 aa  1085    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  82.6 
 
 		 731 aa  1252    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  56.4 
 
 		 727 aa  817    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  45.34 
 
 		 740 aa  670    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  46.48 
 
 		 730 aa  640    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  82.47 
 
 		 730 aa  1221    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  57.01 
 
 		 727 aa  832    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  100 
 
 		 730 aa  1490    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  67.35 
 
 		 730 aa  1000    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  47.14 
 
 		 734 aa  700    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.89 
 
 		 844 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  32.5 
 
 		 842 aa  416  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  36.03 
 
 		 828 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  30.3 
 
 		 702 aa  299  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  31.66 
 
 		 697 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.75 
 
 		 696 aa  294  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  31.49 
 
 		 695 aa  292  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  30.52 
 
 		 695 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  30.52 
 
 		 695 aa  291  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  35.73 
 
 		 848 aa  290  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  30.74 
 
 		 695 aa  290  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  30.96 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  30.41 
 
 		 688 aa  288  2e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.34 
 
 		 692 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  31.44 
 
 		 691 aa  286  9e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  29.9 
 
 		 689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  30.46 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  30.12 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.39 
 
 		 700 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  30.38 
 
 		 705 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  29.13 
 
 		 703 aa  283  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  29.44 
 
 		 705 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.45 
 
 		 692 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.02 
 
 		 696 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.2 
 
 		 692 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  30.3 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.3 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  30.3 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.3 
 
 		 692 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.9 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  29.35 
 
 		 691 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  29.35 
 
 		 691 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  30.41 
 
 		 691 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.16 
 
 		 692 aa  281  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  29.91 
 
 		 692 aa  281  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  30.74 
 
 		 694 aa  280  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  29.97 
 
 		 698 aa  280  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  30.74 
 
 		 694 aa  280  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  30.38 
 
 		 691 aa  280  8e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  29.91 
 
 		 692 aa  280  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  30.03 
 
 		 692 aa  280  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  29.91 
 
 		 692 aa  280  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  29.93 
 
 		 694 aa  280  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  31.01 
 
 		 698 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  30.42 
 
 		 692 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  29.4 
 
 		 691 aa  279  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  30.24 
 
 		 691 aa  279  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  30.52 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  30.86 
 
 		 701 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  31.53 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  29.89 
 
 		 692 aa  278  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  31.53 
 
 		 699 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  31.17 
 
 		 701 aa  277  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  29.16 
 
 		 692 aa  277  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  30.48 
 
 		 698 aa  276  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  29.89 
 
 		 691 aa  276  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16260  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.28 
 
 		 703 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000508186  hitchhiker  0.00001782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  30.32 
 
 		 692 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  31.07 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  30.04 
 
 		 698 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  29.55 
 
 		 699 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  31.02 
 
 		 700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  27.61 
 
 		 692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  29.17 
 
 		 692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  30.56 
 
 		 691 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  30.34 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  30.34 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  30.42 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  30.54 
 
 		 701 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  30.42 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  30.42 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  30.42 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>