More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1090 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  55.6 
 
 
736 aa  884    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  44.52 
 
 
730 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  45.68 
 
 
730 aa  685    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  44.31 
 
 
730 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  45.53 
 
 
727 aa  663    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  93.92 
 
 
740 aa  1427    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  45.24 
 
 
727 aa  661    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.34 
 
 
730 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  44.19 
 
 
731 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  54.64 
 
 
736 aa  874    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  43.72 
 
 
730 aa  635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  44.98 
 
 
727 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  100 
 
 
740 aa  1505    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  45.89 
 
 
734 aa  676    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  45.08 
 
 
730 aa  638    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  76.29 
 
 
740 aa  1190    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  95.14 
 
 
740 aa  1437    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  64.61 
 
 
734 aa  1003    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  95.68 
 
 
740 aa  1447    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  45.12 
 
 
727 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  44.66 
 
 
731 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  44.81 
 
 
727 aa  652    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  41.56 
 
 
729 aa  592  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  41.01 
 
 
728 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  42.43 
 
 
732 aa  589  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  40.46 
 
 
729 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  41.28 
 
 
728 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  40.88 
 
 
729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.92 
 
 
828 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.73 
 
 
844 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  38.36 
 
 
848 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.69 
 
 
842 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  36.27 
 
 
826 aa  296  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  26.76 
 
 
700 aa  253  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  27.2 
 
 
704 aa  250  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.95 
 
 
715 aa  251  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  27.87 
 
 
703 aa  250  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.54 
 
 
701 aa  249  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.53 
 
 
706 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  27.85 
 
 
692 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  28.3 
 
 
698 aa  247  6e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  27.56 
 
 
709 aa  247  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  27.55 
 
 
697 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  26.79 
 
 
705 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  27.84 
 
 
699 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  28.23 
 
 
705 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  26.62 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  28.28 
 
 
692 aa  244  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.99 
 
 
703 aa  245  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.78 
 
 
700 aa  244  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  27.59 
 
 
691 aa  244  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.27 
 
 
695 aa  243  9e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  28.28 
 
 
705 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  26.91 
 
 
699 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  27.98 
 
 
695 aa  242  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  27.39 
 
 
694 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  26.39 
 
 
704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.5 
 
 
704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  26.64 
 
 
707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  26.85 
 
 
698 aa  241  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  27.26 
 
 
694 aa  241  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.99 
 
 
691 aa  241  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  29.08 
 
 
699 aa  241  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.99 
 
 
691 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.38 
 
 
691 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.38 
 
 
691 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.88 
 
 
689 aa  240  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.63 
 
 
689 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.13 
 
 
694 aa  239  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  27.97 
 
 
691 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  28.24 
 
 
695 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  25.7 
 
 
704 aa  238  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.11 
 
 
692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  27.08 
 
 
696 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  28.84 
 
 
692 aa  237  6e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  26.98 
 
 
700 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  26.55 
 
 
708 aa  237  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  27.84 
 
 
696 aa  236  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  26.88 
 
 
700 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1427  elongation factor G  27.73 
 
 
699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00527133  normal  0.0124336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  26.81 
 
 
701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.99 
 
 
702 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.11 
 
 
697 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  26.79 
 
 
693 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  27.32 
 
 
698 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1329  elongation factor G  27.33 
 
 
699 aa  235  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250131  normal  0.0892701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.48 
 
 
691 aa  235  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  27.1 
 
 
699 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  27.38 
 
 
704 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.08 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  29.34 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  27.89 
 
 
691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  27.89 
 
 
691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  26.91 
 
 
700 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>