More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2874 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  46.12 
 
 		 736 aa  664    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  100 
 
 		 729 aa  1468    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  53.22 
 
 		 727 aa  777    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  58.45 
 
 		 732 aa  835    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  58.49 
 
 		 730 aa  853    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  91.36 
 
 		 729 aa  1353    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  53.47 
 
 		 734 aa  780    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  60.74 
 
 		 730 aa  867    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  53.7 
 
 		 727 aa  778    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  51.99 
 
 		 727 aa  770    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  87.93 
 
 		 728 aa  1303    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  60.11 
 
 		 731 aa  887    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  45.58 
 
 		 736 aa  662    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  59.32 
 
 		 730 aa  889    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  87.38 
 
 		 729 aa  1319    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  87.24 
 
 		 728 aa  1315    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  52.95 
 
 		 727 aa  773    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  60.47 
 
 		 731 aa  898    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  59.78 
 
 		 730 aa  855    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  58.9 
 
 		 730 aa  839    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  52.81 
 
 		 727 aa  772    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  45.36 
 
 		 734 aa  647    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  43.09 
 
 		 740 aa  614  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  41.56 
 
 		 740 aa  600  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  41.98 
 
 		 740 aa  597  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  41.84 
 
 		 740 aa  594  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  41.43 
 
 		 740 aa  592  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  41.51 
 
 		 730 aa  580  1e-164  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  32.28 
 
 		 828 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  31.41 
 
 		 688 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.78 
 
 		 844 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  30.68 
 
 		 706 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.33 
 
 		 696 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  29.2 
 
 		 693 aa  271  5e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  30.34 
 
 		 689 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  29.36 
 
 		 701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.69 
 
 		 697 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  29.55 
 
 		 694 aa  263  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  29.55 
 
 		 694 aa  263  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  29.79 
 
 		 700 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  29.82 
 
 		 696 aa  262  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  30.66 
 
 		 701 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  29.54 
 
 		 698 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  29.11 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  29.59 
 
 		 801 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  29.61 
 
 		 802 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  29.59 
 
 		 704 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  29.59 
 
 		 704 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  29.59 
 
 		 704 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  29.59 
 
 		 704 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  32.25 
 
 		 848 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  31.65 
 
 		 842 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  30.05 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  30.04 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  29.44 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  29.69 
 
 		 703 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  28.67 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  30.17 
 
 		 723 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  30.03 
 
 		 698 aa  258  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  29.59 
 
 		 701 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  29.38 
 
 		 702 aa  257  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  29.69 
 
 		 703 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  30 
 
 		 700 aa  257  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  29.82 
 
 		 703 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  29.16 
 
 		 704 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  29.46 
 
 		 704 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  30.21 
 
 		 695 aa  256  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  29.82 
 
 		 703 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000147912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  29.27 
 
 		 703 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  28.63 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  29.81 
 
 		 698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.04 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  29.49 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  29.76 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  30.15 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  30.15 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  29.76 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  28.69 
 
 		 700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  30 
 
 		 700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  29.55 
 
 		 747 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.21 
 
 		 691 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  29.48 
 
 		 700 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  29.48 
 
 		 700 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.01 
 
 		 700 aa  255  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  29.8 
 
 		 700 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  28.98 
 
 		 699 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0270  elongation factor G  29.04 
 
 		 702 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000351784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  29.34 
 
 		 703 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  29.26 
 
 		 692 aa  253  7e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  28.61 
 
 		 701 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  29.59 
 
 		 698 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  30.41 
 
 		 700 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  29.2 
 
 		 700 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>