More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_52010 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  63.62 
 
 
844 aa  1105    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  62.8 
 
 
826 aa  1075    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  100 
 
 
848 aa  1770    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  59.26 
 
 
828 aa  1015    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  62.82 
 
 
842 aa  1089    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  38.88 
 
 
994 aa  570  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  37.24 
 
 
974 aa  558  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  36.3 
 
 
985 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  35.31 
 
 
1013 aa  506  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  35.02 
 
 
734 aa  483  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  33.33 
 
 
736 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  32.19 
 
 
736 aa  447  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  33.65 
 
 
730 aa  421  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  32.51 
 
 
729 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  31.86 
 
 
1001 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  30.32 
 
 
978 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  37.79 
 
 
740 aa  336  9e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  38.36 
 
 
740 aa  335  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  38.36 
 
 
740 aa  325  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  38.36 
 
 
740 aa  324  4e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  37.57 
 
 
740 aa  321  3e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  37.02 
 
 
730 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  35.92 
 
 
732 aa  293  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  35.73 
 
 
730 aa  290  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  35.12 
 
 
730 aa  289  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  34.38 
 
 
734 aa  288  4e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  36.08 
 
 
731 aa  288  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  35.65 
 
 
730 aa  281  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  33.6 
 
 
727 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  33.4 
 
 
727 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  33.01 
 
 
730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  33.01 
 
 
727 aa  270  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  32.55 
 
 
727 aa  268  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  32.81 
 
 
727 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  34.51 
 
 
731 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  32.25 
 
 
729 aa  250  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  34.74 
 
 
1115 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  31.08 
 
 
728 aa  242  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  36.64 
 
 
1035 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  31.54 
 
 
729 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  30.89 
 
 
728 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  25.56 
 
 
704 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  26.5 
 
 
707 aa  187  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  26.26 
 
 
704 aa  187  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  24.27 
 
 
690 aa  183  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  25.87 
 
 
692 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  25.78 
 
 
699 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  26.95 
 
 
705 aa  180  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  26.73 
 
 
705 aa  180  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  25.43 
 
 
700 aa  179  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  25.74 
 
 
689 aa  178  4e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  25.34 
 
 
703 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  24.11 
 
 
697 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  26.41 
 
 
706 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5571  translation elongation factor G  24.41 
 
 
702 aa  171  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  25.09 
 
 
694 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  25.56 
 
 
689 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  25.46 
 
 
705 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  25.09 
 
 
694 aa  169  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0597  elongation factor G  23.66 
 
 
704 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0295214  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  25.88 
 
 
698 aa  168  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  24.35 
 
 
698 aa  167  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  25.52 
 
 
694 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  25.16 
 
 
691 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  25.56 
 
 
697 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  24.54 
 
 
700 aa  164  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029839  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  24 
 
 
690 aa  164  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0577  elongation factor G  26.23 
 
 
706 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  24.08 
 
 
695 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  24.91 
 
 
691 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  24.88 
 
 
694 aa  161  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1199  elongation factor G  24.88 
 
 
694 aa  161  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0695  elongation factor G  25.12 
 
 
694 aa  161  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000135868  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0663  elongation factor G  25.12 
 
 
694 aa  161  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  24.73 
 
 
701 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2958  elongation factor G  24.01 
 
 
697 aa  160  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000380689  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  24.78 
 
 
691 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  25.49 
 
 
691 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  24.76 
 
 
680 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  24.85 
 
 
690 aa  159  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  23.92 
 
 
691 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  25.43 
 
 
698 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  24.63 
 
 
696 aa  156  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  23.69 
 
 
690 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  24.84 
 
 
690 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  24.22 
 
 
697 aa  154  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2198  elongation factor G  23.12 
 
 
694 aa  154  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000586447  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  24.36 
 
 
690 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  24.24 
 
 
691 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3436  elongation factor G  23.41 
 
 
697 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000032533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  24.24 
 
 
691 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  24.43 
 
 
691 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  24.64 
 
 
691 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1953  elongation factor G  24.63 
 
 
694 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0878239  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  24.26 
 
 
691 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  24.02 
 
 
690 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  24.11 
 
 
691 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1799  elongation factor G  24.05 
 
 
694 aa  151  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000204091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0930  elongation factor G  23.99 
 
 
697 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000763506  hitchhiker  0.00992492 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  24.11 
 
 
691 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>