More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_438 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  100 
 
 
1001 aa  2057    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  32.13 
 
 
844 aa  452  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  32.31 
 
 
828 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  32.36 
 
 
826 aa  438  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  32.57 
 
 
842 aa  439  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  31.83 
 
 
848 aa  438  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  28.63 
 
 
974 aa  357  7.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  27.62 
 
 
985 aa  331  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  35.07 
 
 
1115 aa  328  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  27.81 
 
 
994 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  41.98 
 
 
1035 aa  298  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  26.75 
 
 
1013 aa  285  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  25.17 
 
 
978 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  34.89 
 
 
693 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  26.55 
 
 
740 aa  162  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  35.29 
 
 
736 aa  157  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  36.47 
 
 
736 aa  155  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  26.6 
 
 
740 aa  153  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  25.7 
 
 
740 aa  152  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  26.25 
 
 
740 aa  152  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  26.03 
 
 
740 aa  152  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  44.38 
 
 
728 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  44.94 
 
 
729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  36.9 
 
 
727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  44.75 
 
 
729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  44.51 
 
 
729 aa  149  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  24.12 
 
 
734 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  26.42 
 
 
728 aa  146  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  36.11 
 
 
727 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  35.86 
 
 
731 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  36.11 
 
 
727 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  40.98 
 
 
734 aa  144  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  41.3 
 
 
727 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  35.71 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  40.98 
 
 
730 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  39.67 
 
 
730 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  32.53 
 
 
731 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  35.86 
 
 
730 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  40.76 
 
 
730 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  33.71 
 
 
730 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  34.12 
 
 
732 aa  124  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  32.16 
 
 
616 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  40.22 
 
 
730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  31.67 
 
 
607 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  39.02 
 
 
629 aa  112  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  38.93 
 
 
604 aa  112  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  32.34 
 
 
608 aa  112  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  41.89 
 
 
611 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  38.26 
 
 
614 aa  112  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  35.5 
 
 
608 aa  111  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  37.21 
 
 
603 aa  111  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0722  GTP-binding protein TypA  34.78 
 
 
611 aa  111  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  37.84 
 
 
606 aa  110  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  33.65 
 
 
598 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  37.84 
 
 
608 aa  110  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  33.65 
 
 
598 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  33.65 
 
 
598 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  39.6 
 
 
603 aa  109  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  38.26 
 
 
610 aa  109  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  35.88 
 
 
602 aa  109  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  37.06 
 
 
597 aa  109  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  32.21 
 
 
600 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  38.78 
 
 
610 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  39.19 
 
 
608 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  33.97 
 
 
600 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  41.61 
 
 
640 aa  108  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  35.88 
 
 
600 aa  108  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  37.06 
 
 
597 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  37.84 
 
 
594 aa  108  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  36.84 
 
 
592 aa  108  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  34.88 
 
 
601 aa  108  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  34.1 
 
 
598 aa  108  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  34.3 
 
 
599 aa  108  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  31.38 
 
 
615 aa  107  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  33.53 
 
 
598 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  37.58 
 
 
602 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  39.6 
 
 
605 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  39.19 
 
 
614 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  36.49 
 
 
605 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  35.88 
 
 
596 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  39.19 
 
 
608 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  32.86 
 
 
602 aa  107  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  37.58 
 
 
602 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  35.93 
 
 
609 aa  106  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  35.03 
 
 
645 aa  106  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  36.47 
 
 
598 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.47 
 
 
596 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  39.6 
 
 
632 aa  107  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  38.26 
 
 
608 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  35.19 
 
 
608 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  40 
 
 
630 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  38.37 
 
 
603 aa  106  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  36.91 
 
 
602 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  37.16 
 
 
615 aa  106  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  37.58 
 
 
602 aa  107  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  33.53 
 
 
601 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  37.16 
 
 
615 aa  106  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  36.47 
 
 
598 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  39.19 
 
 
614 aa  106  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  39.46 
 
 
596 aa  106  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>