More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1044 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  51.1 
 
 		 704 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  51.1 
 
 		 704 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  53.17 
 
 		 689 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  53.88 
 
 		 692 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  50.59 
 
 		 707 aa  696    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  50.15 
 
 		 693 aa  687    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  52.22 
 
 		 698 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  51.18 
 
 		 691 aa  700    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  51.24 
 
 		 703 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  51.84 
 
 		 700 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  52.54 
 
 		 692 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  50.3 
 
 		 691 aa  701    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  52.46 
 
 		 692 aa  714    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  50.73 
 
 		 698 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  52.54 
 
 		 692 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  52.54 
 
 		 692 aa  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  52.39 
 
 		 692 aa  715    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  52.35 
 
 		 704 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  51.92 
 
 		 700 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  51.84 
 
 		 694 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  51.84 
 
 		 694 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  48.97 
 
 		 708 aa  677    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.29 
 
 		 697 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  53.76 
 
 		 704 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  51.69 
 
 		 702 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  52.14 
 
 		 701 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  51.27 
 
 		 690 aa  702    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.78 
 
 		 696 aa  714    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  49.93 
 
 		 690 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  50.45 
 
 		 692 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  52.35 
 
 		 704 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  51.92 
 
 		 700 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  51.84 
 
 		 697 aa  731    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  53.43 
 
 		 692 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  51.62 
 
 		 700 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  52.06 
 
 		 701 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  51.03 
 
 		 704 aa  705    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  50.6 
 
 		 691 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  50.74 
 
 		 704 aa  707    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  49.93 
 
 		 691 aa  685    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  53.28 
 
 		 692 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  51.11 
 
 		 688 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  51.33 
 
 		 693 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  50.07 
 
 		 700 aa  683    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  52.54 
 
 		 692 aa  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  49.63 
 
 		 696 aa  688    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  49.48 
 
 		 691 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  50.59 
 
 		 694 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  50.89 
 
 		 696 aa  708    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  52.47 
 
 		 692 aa  722    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  55.82 
 
 		 692 aa  768    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  52.35 
 
 		 704 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  51.92 
 
 		 700 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  52.77 
 
 		 697 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  54.91 
 
 		 698 aa  732    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  50 
 
 		 690 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  51.49 
 
 		 690 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  51.12 
 
 		 690 aa  700    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  49.34 
 
 		 700 aa  684    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  49.55 
 
 		 690 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  49.04 
 
 		 697 aa  698    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  49.78 
 
 		 700 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  50.66 
 
 		 700 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  51.1 
 
 		 701 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  50.15 
 
 		 698 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  50 
 
 		 690 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.76 
 
 		 706 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  49.12 
 
 		 708 aa  681    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  51.76 
 
 		 703 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  52.28 
 
 		 702 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  52.98 
 
 		 697 aa  773    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  51.26 
 
 		 696 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  51.85 
 
 		 697 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  52.05 
 
 		 747 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  51.47 
 
 		 700 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  51.78 
 
 		 701 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  52.09 
 
 		 715 aa  697    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  51.25 
 
 		 701 aa  695    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  50 
 
 		 696 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  50.45 
 
 		 688 aa  693    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  50.3 
 
 		 688 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  49.63 
 
 		 691 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  51.03 
 
 		 698 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  51.03 
 
 		 698 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  51.32 
 
 		 699 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  50.59 
 
 		 698 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  50.67 
 
 		 694 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.82 
 
 		 691 aa  699    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  51.77 
 
 		 700 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  51.91 
 
 		 703 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  49.7 
 
 		 702 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  50.45 
 
 		 698 aa  706    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  52.31 
 
 		 693 aa  716    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  52.72 
 
 		 713 aa  720    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  51.62 
 
 		 700 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  52.2 
 
 		 703 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  100 
 
 		 706 aa  1444    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  52.02 
 
 		 692 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  51.03 
 
 		 698 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  54.3 
 
 		 700 aa  748    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>