More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2521 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  48.32 
 
 		 691 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  48.69 
 
 		 700 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  77 
 
 		 689 aa  1031    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.54 
 
 		 692 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  47.32 
 
 		 704 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  50.59 
 
 		 697 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  46.22 
 
 		 699 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  47.45 
 
 		 698 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  51.09 
 
 		 688 aa  674    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  46.27 
 
 		 692 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  47.87 
 
 		 691 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  68.7 
 
 		 688 aa  945    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  46.47 
 
 		 691 aa  641    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  46.72 
 
 		 699 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  49.13 
 
 		 695 aa  666    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  47.28 
 
 		 689 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  45.83 
 
 		 692 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.28 
 
 		 692 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  48.83 
 
 		 691 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  50.51 
 
 		 690 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  48.48 
 
 		 702 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.44 
 
 		 694 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.58 
 
 		 694 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  48.25 
 
 		 680 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  47.07 
 
 		 689 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  47.3 
 
 		 698 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  50 
 
 		 701 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  47.61 
 
 		 704 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  48.75 
 
 		 690 aa  668    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.12 
 
 		 693 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  48.91 
 
 		 695 aa  647    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  46.62 
 
 		 691 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  48.11 
 
 		 691 aa  646    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  63.1 
 
 		 691 aa  846    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  48.32 
 
 		 692 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  47.37 
 
 		 689 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  66.08 
 
 		 684 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  47.72 
 
 		 691 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  45.68 
 
 		 697 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.51 
 
 		 692 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  100 
 
 		 688 aa  1385    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  47.95 
 
 		 693 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  46.92 
 
 		 692 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.61 
 
 		 689 aa  675    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  50.14 
 
 		 701 aa  668    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  47.95 
 
 		 689 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  46.41 
 
 		 691 aa  645    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  47.67 
 
 		 692 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  47.95 
 
 		 697 aa  657    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  49.27 
 
 		 692 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47 
 
 		 692 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  65.05 
 
 		 703 aa  894    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  48.09 
 
 		 697 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  46.12 
 
 		 692 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  47.87 
 
 		 690 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  46.59 
 
 		 698 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  46.78 
 
 		 692 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.91 
 
 		 700 aa  659    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.3 
 
 		 698 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  45.83 
 
 		 691 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  47.45 
 
 		 699 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.27 
 
 		 691 aa  644    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  51.11 
 
 		 706 aa  694    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  46.49 
 
 		 690 aa  652    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  47.14 
 
 		 691 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  45.96 
 
 		 691 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47 
 
 		 692 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  46.28 
 
 		 700 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  47.72 
 
 		 700 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  46.93 
 
 		 689 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  47.45 
 
 		 700 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  47.59 
 
 		 698 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  46.64 
 
 		 697 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  47.71 
 
 		 705 aa  652    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  47.11 
 
 		 697 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  48.1 
 
 		 697 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.17 
 
 		 715 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  46.47 
 
 		 691 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  47.42 
 
 		 692 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  48.63 
 
 		 697 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  48.68 
 
 		 691 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  46.44 
 
 		 698 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  46.44 
 
 		 698 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  48.09 
 
 		 697 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  45.75 
 
 		 692 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  48.12 
 
 		 706 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  46.37 
 
 		 699 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  45.68 
 
 		 692 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  45.96 
 
 		 698 aa  637    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  46.93 
 
 		 691 aa  639    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  47.37 
 
 		 691 aa  636    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  46.49 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  46.88 
 
 		 699 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.62 
 
 		 704 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  45.85 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  46.32 
 
 		 704 aa  632  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  46.73 
 
 		 704 aa  632  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  45.56 
 
 		 701 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  46.49 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>