More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0197 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  46.11 
 
 		 700 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  60.15 
 
 		 684 aa  826    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  62.37 
 
 		 689 aa  829    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  46.47 
 
 		 692 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  57.7 
 
 		 703 aa  810    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.78 
 
 		 691 aa  641    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  44.61 
 
 		 689 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  48.02 
 
 		 690 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  47.67 
 
 		 688 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  46.09 
 
 		 689 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  45.74 
 
 		 691 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  45.09 
 
 		 694 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  45.09 
 
 		 694 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  45.85 
 
 		 699 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  44.74 
 
 		 697 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.5 
 
 		 697 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  46.99 
 
 		 689 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  45.79 
 
 		 692 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.97 
 
 		 691 aa  652    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  100 
 
 		 691 aa  1402    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  46.47 
 
 		 692 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  45.85 
 
 		 699 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  46.03 
 
 		 692 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  45.41 
 
 		 691 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45 
 
 		 692 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  46.62 
 
 		 692 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  63.1 
 
 		 688 aa  864    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  46.75 
 
 		 697 aa  655    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.74 
 
 		 691 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  46.04 
 
 		 694 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  44.71 
 
 		 690 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.76 
 
 		 692 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  44.88 
 
 		 697 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.29 
 
 		 689 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  45.44 
 
 		 692 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  45.52 
 
 		 697 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  46.26 
 
 		 692 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  46.82 
 
 		 697 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  44.88 
 
 		 697 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.12 
 
 		 715 aa  646    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.42 
 
 		 692 aa  661    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.62 
 
 		 692 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  62.37 
 
 		 688 aa  868    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  45.29 
 
 		 691 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  48.44 
 
 		 680 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.29 
 
 		 697 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  44.13 
 
 		 698 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  45.29 
 
 		 692 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  48.97 
 
 		 706 aa  673    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.88 
 
 		 692 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  46.8 
 
 		 706 aa  635  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  46.06 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  45.89 
 
 		 695 aa  633  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  44.72 
 
 		 704 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  45.88 
 
 		 695 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  45.71 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  44.92 
 
 		 691 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  45.3 
 
 		 699 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  45.07 
 
 		 691 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  44.88 
 
 		 689 aa  633  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  45.12 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45 
 
 		 692 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  45.3 
 
 		 699 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.94 
 
 		 700 aa  630  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  44.71 
 
 		 692 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  45.05 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  45 
 
 		 692 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  46.04 
 
 		 698 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  45.28 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  45.19 
 
 		 705 aa  631  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  45.29 
 
 		 692 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  45.27 
 
 		 698 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  44.91 
 
 		 698 aa  627  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  44.87 
 
 		 693 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  45.91 
 
 		 701 aa  628  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  44.12 
 
 		 689 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  43.98 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  44.79 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  44.2 
 
 		 693 aa  626  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  44.12 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  44.69 
 
 		 698 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  45.92 
 
 		 701 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  44.15 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  45.13 
 
 		 698 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  45.76 
 
 		 691 aa  628  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  44.22 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  625  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  43.17 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  45.21 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  44.22 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  43.82 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  44.22 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  45.78 
 
 		 701 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>