More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2171 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  46.19 
 
 
689 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  65.35 
 
 
689 aa  853    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  46.55 
 
 
692 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  46.46 
 
 
691 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  46.24 
 
 
691 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.08 
 
 
689 aa  661    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  46.53 
 
 
704 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  100 
 
 
684 aa  1371    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  46.89 
 
 
689 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  48.01 
 
 
697 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  48.1 
 
 
691 aa  670    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  46.41 
 
 
689 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  60.15 
 
 
691 aa  796    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  47.07 
 
 
692 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.07 
 
 
692 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  70.51 
 
 
703 aa  960    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  46.59 
 
 
705 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  44.28 
 
 
692 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  45.36 
 
 
692 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  66.08 
 
 
688 aa  895    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.52 
 
 
697 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  48.24 
 
 
692 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  46.33 
 
 
692 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  48.97 
 
 
690 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.43 
 
 
697 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  46.31 
 
 
697 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  45.43 
 
 
689 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  44.74 
 
 
692 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  48.25 
 
 
700 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  45.56 
 
 
691 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  46.18 
 
 
689 aa  654    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.72 
 
 
697 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  49.71 
 
 
688 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  68.09 
 
 
688 aa  918    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  47.21 
 
 
691 aa  636    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  49.49 
 
 
695 aa  663    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  46.39 
 
 
692 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  44.89 
 
 
693 aa  636    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.34 
 
 
700 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  44.62 
 
 
690 aa  642    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  47.02 
 
 
706 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  45.41 
 
 
691 aa  633  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  44.64 
 
 
692 aa  632  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  45.86 
 
 
692 aa  632  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  44.72 
 
 
694 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  44.97 
 
 
692 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  44.54 
 
 
692 aa  634  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  45.41 
 
 
691 aa  633  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  44.97 
 
 
691 aa  633  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  47.3 
 
 
700 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.95 
 
 
697 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  46.12 
 
 
699 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  47.08 
 
 
700 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  46.09 
 
 
704 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  45.96 
 
 
699 aa  628  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  44.18 
 
 
693 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  47.51 
 
 
702 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  44.57 
 
 
694 aa  632  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  47.12 
 
 
692 aa  631  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  45.96 
 
 
699 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  45.49 
 
 
691 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  46.69 
 
 
694 aa  631  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.28 
 
 
697 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  47.58 
 
 
698 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  45.56 
 
 
691 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  46.12 
 
 
691 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45.53 
 
 
692 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  44.41 
 
 
704 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  47.22 
 
 
701 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  46.68 
 
 
692 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  45.15 
 
 
704 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.15 
 
 
691 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  44.4 
 
 
704 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  43.57 
 
 
692 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  45.48 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.84 
 
 
715 aa  628  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  45.19 
 
 
692 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  46.31 
 
 
698 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  46.75 
 
 
697 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  46.51 
 
 
698 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  45.18 
 
 
691 aa  622  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  45.04 
 
 
692 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  44.54 
 
 
704 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  45.19 
 
 
692 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  45.19 
 
 
692 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  45.04 
 
 
692 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  45.19 
 
 
692 aa  625  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  46.45 
 
 
691 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  45.19 
 
 
692 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  46.15 
 
 
691 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  44.19 
 
 
700 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.96 
 
 
692 aa  625  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  44.56 
 
 
700 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  47.91 
 
 
680 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  45.04 
 
 
692 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  45.23 
 
 
705 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.9 
 
 
692 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  43.62 
 
 
701 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  46.3 
 
 
693 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>