More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3451 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  59.17 
 
 		 704 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  59.17 
 
 		 704 aa  833    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  63.43 
 
 		 692 aa  908    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  56.94 
 
 		 703 aa  834    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  56.67 
 
 		 693 aa  817    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  60.29 
 
 		 698 aa  862    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  62.59 
 
 		 691 aa  915    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  59.77 
 
 		 703 aa  854    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  57.99 
 
 		 700 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  61.97 
 
 		 692 aa  878    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  58.87 
 
 		 691 aa  848    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  59.07 
 
 		 692 aa  853    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  68.68 
 
 		 694 aa  981    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  58.87 
 
 		 698 aa  839    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  61.97 
 
 		 692 aa  878    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  61.97 
 
 		 692 aa  878    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  60.76 
 
 		 689 aa  855    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  61.68 
 
 		 692 aa  877    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  61.06 
 
 		 704 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  58.61 
 
 		 700 aa  843    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  60.2 
 
 		 694 aa  873    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  60.2 
 
 		 694 aa  872    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.76 
 
 		 697 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  60.38 
 
 		 704 aa  857    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  59.77 
 
 		 702 aa  854    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  58.71 
 
 		 701 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  63.38 
 
 		 690 aa  920    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.56 
 
 		 696 aa  850    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  88.84 
 
 		 690 aa  1280    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  61.06 
 
 		 704 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  58.61 
 
 		 700 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  60.06 
 
 		 697 aa  851    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  57.22 
 
 		 701 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1708  elongation factor G  68.37 
 
 		 705 aa  981    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  62.24 
 
 		 692 aa  875    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  58.36 
 
 		 700 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  60.75 
 
 		 701 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  58.02 
 
 		 704 aa  835    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  57.88 
 
 		 704 aa  840    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  64.15 
 
 		 692 aa  902    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  59.51 
 
 		 693 aa  821    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  58.27 
 
 		 700 aa  831    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  61.97 
 
 		 692 aa  878    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  57.86 
 
 		 696 aa  837    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  59.57 
 
 		 696 aa  853    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  59.45 
 
 		 689 aa  852    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  69.75 
 
 		 692 aa  1015    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  60.67 
 
 		 692 aa  881    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  61.06 
 
 		 704 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  58.61 
 
 		 700 aa  843    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  61.63 
 
 		 697 aa  915    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  62.02 
 
 		 698 aa  891    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  91.59 
 
 		 690 aa  1320    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  68.31 
 
 		 690 aa  1001    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  61.44 
 
 		 692 aa  876    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  62.79 
 
 		 690 aa  917    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0577  elongation factor G  64.87 
 
 		 706 aa  934    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  58.5 
 
 		 700 aa  831    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  57.88 
 
 		 701 aa  818    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  100 
 
 		 690 aa  1413    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  57.9 
 
 		 697 aa  845    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  58.76 
 
 		 700 aa  850    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  57.12 
 
 		 704 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  58.21 
 
 		 700 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  59.86 
 
 		 701 aa  842    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  92.17 
 
 		 690 aa  1328    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.11 
 
 		 706 aa  826    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  87.97 
 
 		 690 aa  1263    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  59.91 
 
 		 703 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  59.42 
 
 		 702 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  59.22 
 
 		 697 aa  859    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  59.97 
 
 		 696 aa  838    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0241  elongation factor G  65.3 
 
 		 706 aa  942    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449093  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  69.34 
 
 		 697 aa  1009    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  61.03 
 
 		 747 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  59.04 
 
 		 700 aa  849    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  60.96 
 
 		 701 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.66 
 
 		 715 aa  831    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  57.55 
 
 		 701 aa  816    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  71.7 
 
 		 696 aa  1030    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  57.85 
 
 		 688 aa  851    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  57.7 
 
 		 688 aa  849    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  58.65 
 
 		 700 aa  824    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  58.59 
 
 		 698 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  58.59 
 
 		 698 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  59.25 
 
 		 699 aa  819    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  58.5 
 
 		 698 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  71.64 
 
 		 691 aa  1043    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  58.5 
 
 		 700 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  60.72 
 
 		 703 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  57.53 
 
 		 706 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  57.58 
 
 		 702 aa  829    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  58.2 
 
 		 693 aa  844    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  58.87 
 
 		 713 aa  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  59.04 
 
 		 700 aa  849    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  61.32 
 
 		 703 aa  849    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  62.84 
 
 		 692 aa  897    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  58.59 
 
 		 698 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  59.36 
 
 		 700 aa  847    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  59.16 
 
 		 691 aa  856    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>