More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35547 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  50.86 
 
 
985 aa  989    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  100 
 
 
974 aa  2011    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  50 
 
 
994 aa  983    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  37.89 
 
 
978 aa  674    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  46.32 
 
 
1013 aa  885    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  38.69 
 
 
844 aa  609  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  36.64 
 
 
842 aa  576  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  36.97 
 
 
826 aa  562  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  37.24 
 
 
848 aa  559  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  35.84 
 
 
828 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  28.63 
 
 
1001 aa  336  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  32.02 
 
 
740 aa  239  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  31.12 
 
 
734 aa  229  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  29.14 
 
 
740 aa  219  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  31.29 
 
 
736 aa  219  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  30.77 
 
 
736 aa  218  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  25.35 
 
 
732 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  28.63 
 
 
740 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  30.69 
 
 
740 aa  209  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  29.76 
 
 
740 aa  209  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  29.69 
 
 
730 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  28.84 
 
 
731 aa  193  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  27.1 
 
 
730 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  28.32 
 
 
730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  30.17 
 
 
1115 aa  181  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  27.18 
 
 
727 aa  180  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  27.07 
 
 
734 aa  180  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  26.36 
 
 
731 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  26.98 
 
 
727 aa  178  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  27.05 
 
 
727 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  27.43 
 
 
730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  26.82 
 
 
729 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  28.67 
 
 
1035 aa  174  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  26.45 
 
 
727 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  27.15 
 
 
727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  27.22 
 
 
728 aa  161  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  27.22 
 
 
729 aa  160  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  25.86 
 
 
728 aa  157  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  26.29 
 
 
730 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  25.38 
 
 
693 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  27 
 
 
729 aa  152  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  27.29 
 
 
730 aa  147  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  24.24 
 
 
689 aa  135  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  24.63 
 
 
691 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  23.47 
 
 
700 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  22.62 
 
 
700 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  22.56 
 
 
694 aa  112  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  23.28 
 
 
695 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  22.85 
 
 
706 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  25.42 
 
 
695 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1179  GTP-binding protein LepA  38.04 
 
 
599 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000382196  hitchhiker  0.00186525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  25.76 
 
 
692 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  35 
 
 
620 aa  103  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  37.27 
 
 
602 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04711  GTP-binding protein LepA  37.27 
 
 
602 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.772575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04401  GTP-binding protein LepA  37.27 
 
 
602 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  26.76 
 
 
690 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2717  GTP-binding protein LepA  37.42 
 
 
601 aa  102  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04811  GTP-binding protein LepA  36.02 
 
 
602 aa  101  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1786  GTP-binding protein LepA  36.71 
 
 
605 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1677  GTP-binding protein LepA  36.05 
 
 
605 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0355  GTP-binding protein LepA  35.4 
 
 
603 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  36.65 
 
 
603 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1883  GTP-binding protein LepA  38.51 
 
 
599 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00616157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0885  GTP-binding protein LepA  35.8 
 
 
604 aa  100  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0424793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  25.69 
 
 
699 aa  99.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7070  GTP-binding protein LepA  39.26 
 
 
636 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04741  GTP-binding protein LepA  36.65 
 
 
603 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2246  GTP-binding protein LepA  35 
 
 
601 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  36.02 
 
 
604 aa  99.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  35 
 
 
601 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0373  GTP-binding protein LepA  35.4 
 
 
644 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.598212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2334  GTP-binding protein LepA  35 
 
 
601 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.871184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2327  GTP-binding protein LepA  38.51 
 
 
599 aa  99  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0321  GTP-binding protein LepA  36.65 
 
 
600 aa  99  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0469  GTP-binding protein LepA  35.4 
 
 
644 aa  99  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.942925  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  26.33 
 
 
690 aa  99  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  21.1 
 
 
682 aa  99  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1168  GTP-binding protein LepA  38.06 
 
 
605 aa  98.6  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  36.71 
 
 
605 aa  98.6  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3168  GTP-binding protein LepA  36.2 
 
 
600 aa  98.6  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.998124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  36.08 
 
 
601 aa  98.6  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  37.27 
 
 
629 aa  98.6  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1287  GTP-binding protein LepA  38.06 
 
 
605 aa  98.2  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  36.36 
 
 
606 aa  98.2  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3195  GTP-binding protein LepA  41.04 
 
 
598 aa  97.8  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29031  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  36.71 
 
 
605 aa  97.8  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1509  GTP-binding protein LepA  32.24 
 
 
606 aa  97.8  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.783077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  23.84 
 
 
698 aa  97.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2248  GTP-binding protein LepA  37.65 
 
 
603 aa  97.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1569  GTP-binding protein LepA  37.67 
 
 
604 aa  97.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0109281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2503  GTP-binding protein LepA  36.02 
 
 
599 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  25.57 
 
 
690 aa  97.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20941  GTP-binding protein LepA  36.02 
 
 
604 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3360  GTP-binding protein TypA  33.53 
 
 
607 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  34.78 
 
 
610 aa  97.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1620  GTP-binding protein LepA  37.27 
 
 
600 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00547684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3118  GTP-binding protein LepA  36.02 
 
 
599 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204942 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1096  translation elongation factor G  25.71 
 
 
709 aa  96.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1941  GTP-binding protein LepA  32.98 
 
 
602 aa  97.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>