More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2318 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 682 aa  1361    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  44.96 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.7 
 
 		 692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.06 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  44.96 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  43.37 
 
 		 695 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  44.59 
 
 		 696 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  43.59 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  44.31 
 
 		 685 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  43.48 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  44.94 
 
 		 686 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  42.3 
 
 		 679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  42.73 
 
 		 701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  42.27 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  43.17 
 
 		 701 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  42.71 
 
 		 694 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  43.26 
 
 		 692 aa  558  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.35 
 
 		 696 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  42.59 
 
 		 697 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  43.76 
 
 		 688 aa  555  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  41.13 
 
 		 697 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.05 
 
 		 696 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  42.11 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  44.25 
 
 		 680 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  43.3 
 
 		 688 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  40.71 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  38.84 
 
 		 694 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  43.36 
 
 		 701 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  40.12 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  41.09 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  39.91 
 
 		 688 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  40.65 
 
 		 683 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  42.35 
 
 		 687 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  39.74 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  39.82 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  40.71 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  40.32 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.74 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  40.44 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  39.14 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  38.7 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  37.83 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  40.27 
 
 		 692 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.97 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.74 
 
 		 683 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  39.44 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  40.5 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.42 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.76 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.83 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  39.15 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  39.15 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  39.15 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  39.31 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  39.15 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  39 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  39.16 
 
 		 692 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  38.55 
 
 		 695 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  39.15 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  39.62 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  39 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  39.83 
 
 		 701 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  39.03 
 
 		 692 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  38.96 
 
 		 682 aa  495  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  38.71 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  38.44 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  39.47 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  38.35 
 
 		 697 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  41.54 
 
 		 707 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  39.74 
 
 		 703 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  39.32 
 
 		 673 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  38.27 
 
 		 692 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  37.81 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  38.94 
 
 		 691 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  38.94 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  40.11 
 
 		 701 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  39.1 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  37.98 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  39.23 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.1 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  41.21 
 
 		 697 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  38.05 
 
 		 697 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  38.5 
 
 		 697 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  38.44 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  38.73 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  39.09 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  38.05 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  37.32 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  37.68 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  38.64 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  38.69 
 
 		 700 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  39.04 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  37.61 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  39.04 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  38.7 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  39.88 
 
 		 693 aa  485  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  38.29 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  38.21 
 
 		 704 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  37.9 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  39.12 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>