More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36549 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  100 
 
 		 1035 aa  2122    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  41.66 
 
 		 1115 aa  797    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  38.84 
 
 		 1001 aa  290  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  36.97 
 
 		 826 aa  261  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.4 
 
 		 842 aa  258  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  36.88 
 
 		 848 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.86 
 
 		 828 aa  254  8.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  35.56 
 
 		 844 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  38.18 
 
 		 693 aa  195  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  28.67 
 
 		 974 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  42.98 
 
 		 736 aa  185  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  42.19 
 
 		 736 aa  181  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  41.98 
 
 		 731 aa  181  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  41.67 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  27.72 
 
 		 985 aa  174  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  38.69 
 
 		 731 aa  174  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  31.88 
 
 		 994 aa  172  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  39.92 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  40.68 
 
 		 728 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  39.41 
 
 		 729 aa  165  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  40.26 
 
 		 734 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  39.83 
 
 		 728 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  39.15 
 
 		 729 aa  162  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  38.56 
 
 		 734 aa  162  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  39.15 
 
 		 740 aa  162  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  40.68 
 
 		 729 aa  161  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  38.46 
 
 		 740 aa  160  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  38.46 
 
 		 740 aa  160  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  38.06 
 
 		 740 aa  160  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  37.25 
 
 		 740 aa  159  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  40.85 
 
 		 727 aa  157  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  40.42 
 
 		 727 aa  157  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  40.85 
 
 		 727 aa  157  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  44.86 
 
 		 727 aa  156  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  41.7 
 
 		 727 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  39.46 
 
 		 732 aa  153  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  40.43 
 
 		 730 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  38.1 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  40 
 
 		 730 aa  147  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  27.36 
 
 		 1013 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  40.43 
 
 		 730 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  25.83 
 
 		 978 aa  132  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1557  GTP-binding protein LepA  37.24 
 
 		 641 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00533017  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  40.82 
 
 		 614 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1146  GTP-binding protein LepA  35.82 
 
 		 634 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5465  GTP-binding protein LepA  34.16 
 
 		 618 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  40.14 
 
 		 606 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  44.37 
 
 		 616 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2216  GTP-binding protein LepA  38.06 
 
 		 630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2283  GTP-binding protein LepA  38.78 
 
 		 612 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  44.37 
 
 		 610 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3261  GTP-binding protein LepA  40.14 
 
 		 612 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0399374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2200  GTP-binding protein LepA  34.95 
 
 		 619 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0990775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3168  GTP-binding protein LepA  39.41 
 
 		 600 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.998124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1977  GTP-binding protein LepA  36 
 
 		 618 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000936428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  35.56 
 
 		 614 aa  115  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  45.45 
 
 		 608 aa  115  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0691  GTP-binding protein LepA  34.83 
 
 		 613 aa  115  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  42.86 
 
 		 608 aa  115  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2045  GTP-binding protein LepA  41.84 
 
 		 601 aa  115  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1891  GTP-binding protein LepA  38.1 
 
 		 635 aa  115  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.647784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1326  GTP-binding protein LepA  42.25 
 
 		 603 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2240  GTP-binding protein LepA  36 
 
 		 617 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  43.92 
 
 		 608 aa  114  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0885  GTP-binding protein LepA  43.66 
 
 		 604 aa  114  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0424793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2790  GTP-binding protein LepA  35.68 
 
 		 627 aa  114  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7070  GTP-binding protein LepA  38.1 
 
 		 636 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0573  GTP-binding protein TypA  37.5 
 
 		 612 aa  114  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.179658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17350  GTP-binding protein LepA  35.23 
 
 		 626 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12410  GTP-binding protein LepA  39.04 
 
 		 619 aa  113  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00127751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1744  GTP-binding protein LepA  34.62 
 
 		 633 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2197  GTP-binding protein LepA  41.5 
 
 		 601 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  41.5 
 
 		 608 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2246  GTP-binding protein LepA  41.96 
 
 		 601 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  42.96 
 
 		 604 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3177  GTP-binding protein LepA  38.36 
 
 		 616 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  34.55 
 
 		 602 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  34.67 
 
 		 682 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1616  GTP-binding protein LepA  40.41 
 
 		 671 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1941  GTP-binding protein LepA  41.55 
 
 		 602 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  42.96 
 
 		 608 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0853  GTP-binding protein LepA  35.5 
 
 		 626 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3841  GTP-binding protein LepA  39.72 
 
 		 640 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159838  hitchhiker  0.00418182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1554  GTP-binding protein LepA  33.01 
 
 		 620 aa  111  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0948  GTP-binding protein LepA  41.55 
 
 		 605 aa  111  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04401  GTP-binding protein LepA  40.69 
 
 		 602 aa  111  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  42.25 
 
 		 602 aa  111  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  41.26 
 
 		 601 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  42.96 
 
 		 594 aa  111  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  40.85 
 
 		 602 aa  111  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04711  GTP-binding protein LepA  40.69 
 
 		 602 aa  111  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.772575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2334  GTP-binding protein LepA  41.26 
 
 		 601 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.871184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  41.26 
 
 		 602 aa  111  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04811  GTP-binding protein LepA  41.38 
 
 		 602 aa  111  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06110  GTP-Binding protein lepA, putative  39.61 
 
 		 693 aa  111  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0166932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2070  GTP-binding protein LepA  43.26 
 
 		 595 aa  111  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282271  normal  0.186175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  40.85 
 
 		 608 aa  111  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  43.66 
 
 		 607 aa  111  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  42.66 
 
 		 610 aa  111  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  41.55 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>