More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1518 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 606 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  54.18 
 
 		 600 aa  655    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  54.39 
 
 		 600 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.45 
 
 		 598 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 603 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 		 606 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 		 615 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 		 608 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  77.96 
 
 		 608 aa  966    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  54.39 
 
 		 598 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 602 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  52.73 
 
 		 613 aa  638    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 		 615 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 612 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 602 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 596 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.56 
 
 		 608 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.56 
 
 		 608 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 605 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 614 aa  648    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 		 598 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  56.04 
 
 		 604 aa  694    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 		 609 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.58 
 
 		 596 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 614 aa  663    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.85 
 
 		 600 aa  654    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 		 606 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  58.63 
 
 		 602 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  85.15 
 
 		 608 aa  1073    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  84.18 
 
 		 610 aa  1073    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 600 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 608 aa  1240    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 602 aa  669    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 598 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 		 614 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  59.11 
 
 		 616 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 600 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.73 
 
 		 597 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 601 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 		 615 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 601 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 592 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1470  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 607 aa  659    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 599 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  57.76 
 
 		 610 aa  718    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 614 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  54.06 
 
 		 608 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  79.63 
 
 		 608 aa  998    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 613 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 597 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  86.47 
 
 		 608 aa  1069    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 608 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 		 614 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  58.77 
 
 		 614 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  54.88 
 
 		 632 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 605 aa  659    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  56.24 
 
 		 597 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 599 aa  656    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 		 605 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 		 593 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  56.24 
 
 		 597 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 608 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  55.35 
 
 		 608 aa  691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 		 608 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  57.44 
 
 		 596 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.24 
 
 		 598 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.56 
 
 		 610 aa  696    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.56 
 
 		 610 aa  696    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  54.81 
 
 		 599 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 		 596 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 		 605 aa  727    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  52.51 
 
 		 621 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  55.35 
 
 		 600 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 		 608 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.82 
 
 		 600 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  60.33 
 
 		 606 aa  748    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 614 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 602 aa  660    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.57 
 
 		 602 aa  662    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  53.4 
 
 		 618 aa  647    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 		 606 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 		 613 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 594 aa  654    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  86.14 
 
 		 608 aa  1087    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.3 
 
 		 602 aa  657    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.17 
 
 		 601 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  53.07 
 
 		 614 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 		 608 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 		 607 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>